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--- tutoriais:apptainer [2024-05-08 11:43] – [Particularidades do ambiente] hcabral
+++ tutoriais:apptainer [2025-05-22 16:03] (current) – david-local
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 Abaixo um guia de como rodar um programa dentro do ambiente (no caso, o R).
-==== Imagens pré-baixadas ====
-Para facilitar, deixaremos algumas imagens baixadas em ''/opt/apptainer''.
-Para rodar o R com a imagem ml-verse:
+==== Executando uma imagem ====
-  apptainer exec --nv /opt/apptainer/ml-verse_latest.sif R
+As imagens são ambientes com as dependências necessárias para que o programa funcione, por isso é preciso primeiro baixá-las. <WRAP>++++ Clique para ver os passos |
-Rodar o ''Rscript'' é análogo.
+Para baixar uma imagem podemos usar o subcomando ''pull'', como:
-Para rodar o RStudio, siga [[servicos:rstudio|o guia]].
-==== Baixando uma imagem ====
-As imagens do Apptainer são ambientes com as dependências necessárias para que o programa funcionar. Para baixar uma imagem podemos usar o subcomando ''pull'', como:
   apptainer pull docker://rocker/ml-verse
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 O comando aceita URIs que apontem para imagens que seguem o padrão OCI. Imagens de docker como a do exemplo costumam funcionar.
-==== Executando uma imagem ====
-Para executar a imagem, utilizamos o subcomando ''apptainer run'', especificando o nome do arquivo da imagem:
+++++
+</WRAP>
+Com o objetivo de facilitar, **deixaremos algumas imagens pré-baixadas em ''/opt/apptainer''**.
+Para executar, utilizamos o comando ''exec'' no escopo da imagem. Como exemplo, utilizaremos a ml-verse (já disponivel nas máquinas):
 <code bash>
-# não deve funcionar, pois o container chama o RStudio por padrão e precisará de alguns bind mounts
+  apptainer exec --nv /opt/apptainer/ml-verse_latest.sif R
-apptainer run ml-verse_latest.sif
 </code>
-Também é possível executar um comando no escopo da imagem:
+Ao executar o comando, o apptainer irá criar um container baseado na imagem e executar o programa.
-  apptainer exec ml-verse_latest.sif R
+Rodar o ''Rscript'' é análogo.
+Para rodar o RStudio, siga [[servicos:rstudio|o guia]].
-Ao executar o comando, o apptainer irá criar um container baseado na imagem e executar o programa.
 ==== Particularidades do ambiente ====