Table of Contents
RStudio
Atualmente, dependendo de onde será executado, o RStudio possui uma forma de executar:
Localmente nos computadores do LABMAE (Sala A250)
O RStudio roda a partir de uma imagem do Apptainer. Temos um script que chama a imagem (ml-verse), sendo necessário especificar a porta da interface web do RStudio.
É preciso escolher uma porta (qualquer número de 10000 a 40000 que já não esteja ocupado por outro processo no computador) e chamar o script com o número:
rstudio_apptainer.sh 12345
O script irá gerar e exibir uma senha de acesso. Basta acessar pelo navegador o endereço http://localhost:12345 e usar a senha para acessar o RStudio.
OBS: O Apptainer para Rstudio na versão ml-verse está depreciado pelo rocker-project, possivelmente será abandonado no futuro.
Nos servidores
Instalado nos servidores Brucutu do modo tradicional. Por se tratar de um programa gráfico, é necessário ativar o modo gráfico do SSH ao realizar a conexão com o servidor ou utilizar o x2go
Pelo SSH:
ssh -XC usuario@brucutu.ime.usp.br
Ao encerrar a janela, o Rstudio é encerrado
Através do x2go: Veja X2go
ssh -L 12345:localhost:12345 usuario@brucutu.ime.usp.br
Então, chamar o script com o mesmo número:
rstudio_apptainer.sh 12345
O script irá gerar e exibir uma senha de acesso. Basta acessar pelo navegador o endereço http://localhost:12345 e usar a senha para acessar o RStudio.
<note tip>Pode ser interessante rodar o rstudio_apptainer.sh dentro de uma screen.</note>
