O IME dispõe dos seguintes laboratórios de informática geridos pela SI:

• Estações de Trabalho A127 - docentes, funcionários e pós-graduandos do IME;
• Sala A101 - docentes do Departamento de Matemática;
• Sala A250 - pós-graduandos do Departamento de Estatística;
• Sala A253 - graduandos da Estatística ou CEA;
• Sala A257 - pós-graduandos do Departamento de Matemática Aplicada.

Outros laboratórios:

• Rede Linux (Pró-Aluno) - graduandos do IME e administrado por alunos do Bacharelado em Computação;
• Centro de Ensino de Computação – centro de informática que disponibiliza laboratório para graduandos e pós-graduandos com administração própria;
• Laboratórios de grupos de pesquisa geridos pelo próprio grupo.

Trata-se do principal laboratório destinado ao público de pós-graduação e a única condição para usá-lo é ter uma conta na Rede IME.

Estão disponíveis 24 computadores com a seguinte configuração:

• Sistema operacional Debian GNU/Linux estável;
• Intel Core i3-8100 (4 núcleos);
• 8GB de memória RAM;
• 240GB de SSD.

Dispomos ainda de mais 4 computadores nas salas de pós-graduação com a configuração acima e outros 3 com a configuração:

• Sistema operacional Debian GNU/Linux estável + Windows 10 Pro;
• Intel Core i3-7100 (2 núcleos);
• 4GB de memória RAM;
• 1TB de HDD.