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--- tutoriais:apptainer [2025-05-22 15:20] – david-local
+++ tutoriais:apptainer [2025-05-22 16:03] (current) – david-local
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 ==== Executando uma imagem ====
-As imagens são ambientes com as dependências necessárias para que o programa funcione, por isso é preciso primeiro baixá-las.
+As imagens são ambientes com as dependências necessárias para que o programa funcione, por isso é preciso primeiro baixá-las. <WRAP>++++ Clique para ver os passos |
-Com o objetivo de facilitar, **deixaremos algumas imagens pré-baixadas em ''/opt/apptainer''**.
+Para baixar uma imagem podemos usar o subcomando ''pull'', como:
-Para executar a imagem, utilizamos o
+  apptainer pull docker://rocker/ml-verse
+O exemplo baixa uma imagem do R do [[ https://rocker-project.org/ | Projeto Rocker ]] que já vem com o R dentro de um ambiente Ubuntu com um repositório de pacotes pré-configurado para instalação mais rápida. A imagem deve ser baixada no diretório onde o comando foi executado, com extensão .sif (no exemplo, seria ''ml-verse_latest.sif'').
+O comando aceita URIs que apontem para imagens que seguem o padrão OCI. Imagens de docker como a do exemplo costumam funcionar.
+++++
+</WRAP>
+Com o objetivo de facilitar, **deixaremos algumas imagens pré-baixadas em ''/opt/apptainer''**.
-subcomando ''apptainer run'', especificando o nome do arquivo da imagem, como exemplo, utilizaremos a imagem ml-verse (já disponivel nas máquinas):
+Para executar, utilizamos o comando ''exec'' no escopo da imagem. Como exemplo, utilizaremos a ml-verse (já disponivel nas máquinas):
 <code bash>
-apptainer run ml-verse_latest.sif
+  apptainer exec --nv /opt/apptainer/ml-verse_latest.sif R
 </code>
-Também é possível executar um comando no escopo da imagem:
-  apptainer exec ml-verse_latest.sif R
 Ao executar o comando, o apptainer irá criar um container baseado na imagem e executar o programa.
-Para rodar o R com a imagem ml-verse:
-  apptainer exec --nv /opt/apptainer/ml-verse_latest.sif R
 Rodar o ''Rscript'' é análogo.
 Para rodar o RStudio, siga [[servicos:rstudio|o guia]].
-==== Baixando uma imagem ====
-Para baixar uma imagem podemos usar o subcomando ''pull'', como:
-  apptainer pull docker://rocker/ml-verse
-O exemplo baixa uma imagem do R do [[ https://rocker-project.org/ | Projeto Rocker ]] que já vem com o R dentro de um ambiente Ubuntu com um repositório de pacotes pré-configurado para instalação mais rápida. A imagem deve ser baixada no diretório onde o comando foi executado, com extensão .sif (no exemplo, seria ''ml-verse_latest.sif'').
-O comando aceita URIs que apontem para imagens que seguem o padrão OCI. Imagens de docker como a do exemplo costumam funcionar.
 ==== Particularidades do ambiente ====