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--- tutoriais:apptainer [2025-05-22 15:05] – david-local
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 ==== Executando uma imagem ====
-As imagens são ambientes com as dependências necessárias para que o programa funcione, por isso é preciso primeiro baixá-las.
+As imagens são ambientes com as dependências necessárias para que o programa funcione, por isso é preciso primeiro baixá-las. <WRAP>++++ Clique para ver os passos |
-Com o objetivo de facilitar, **deixaremos algumas imagens pré-baixadas em ''/opt/apptainer''**.
+Para baixar uma imagem podemos usar o subcomando ''pull'', como:
-Para executar a imagem, utilizamos o subcomando ''apptainer run'', especificando o nome do arquivo da imagem, como exemplo, utilizaremos a imagem ml-verse (já disponivel nas máquinas):
+  apptainer pull docker://rocker/ml-verse
-<code bash>
+O exemplo baixa uma imagem do R do [[ https://rocker-project.org/ | Projeto Rocker ]] que já vem com o R dentro de um ambiente Ubuntu com um repositório de pacotes pré-configurado para instalação mais rápida. A imagem deve ser baixada no diretório onde o comando foi executado, com extensão .sif (no exemplo, seria ''ml-verse_latest.sif'').
-apptainer run ml-verse_latest.sif
-</code>
-Também é possível executar um comando no escopo da imagem:
+O comando aceita URIs que apontem para imagens que seguem o padrão OCI. Imagens de docker como a do exemplo costumam funcionar.
-  apptainer exec ml-verse_latest.sif R
+++++
+</WRAP>
-Ao executar o comando, o apptainer irá criar um container baseado na imagem e executar o programa.
+Com o objetivo de facilitar, **deixaremos algumas imagens pré-baixadas em ''/opt/apptainer''**.
-Para rodar o R com a imagem ml-verse:
+Para executar, utilizamos o comando ''exec'' no escopo da imagem. Como exemplo, utilizaremos a ml-verse (já disponivel nas máquinas):
+<code bash>
   apptainer exec --nv /opt/apptainer/ml-verse_latest.sif R
+</code>
+Ao executar o comando, o apptainer irá criar um container baseado na imagem e executar o programa.
 Rodar o ''Rscript'' é análogo.
 Para rodar o RStudio, siga [[servicos:rstudio|o guia]].
-==== Baixando uma imagem ====
-Para baixar uma imagem podemos usar o subcomando ''pull'', como:
-  apptainer pull docker://rocker/ml-verse
-O exemplo baixa uma imagem do R do [[ https://rocker-project.org/ | Projeto Rocker ]] que já vem com o R dentro de um ambiente Ubuntu com um repositório de pacotes pré-configurado para instalação mais rápida. A imagem deve ser baixada no diretório onde o comando foi executado, com extensão .sif (no exemplo, seria ''ml-verse_latest.sif'').
-O comando aceita URIs que apontem para imagens que seguem o padrão OCI. Imagens de docker como a do exemplo costumam funcionar.
 ==== Particularidades do ambiente ====